绿柄种、红柄种和白柄种是最常见的园艺品种马蹄莲。白色的品种茎块较小，叶柄基部呈白绿色，生长缓慢，花苞数量多呈白色，花期较早，茎块长至一到二厘米就可开花。绿色品种的茎块粗大，叶柄的基部为绿色，生长期短长势快，花茎高达，花期较迟呈黄白色，块茎长到五六厘米才能开花。红色叶柄种类的长势一般，叶柄根部呈红色，花苞为白色，花期早于白柄种晚于绿柄种。

银花马蹄莲、黄花马蹄莲和红花马蹄莲也是马蹄莲属的常见园艺栽培品种。无土栽培马蹄莲有盆栽和槽栽两种形式，植株小且紧凑的白柄种和红花、银花马蹄莲适宜盆栽，采用槽培形式栽培便于采收佛焰苞作为切花。种植槽、滴灌系统、营养液池、水泵和供液定时器组成了马蹄莲的无土栽培系统。

无土培育马蹄莲应选在八月下旬，选出健康无病、大小一致的球茎做种球，按照行距40厘米，间距15厘米，深度三四厘米的标准种植，再在球外侧设两条供养液。种定后开始培育种球。